Yo utilizo Transmission. Me gusta más gráficamente y tiene algunas funcionalidades muy interesantes como correr scripts cuando terminan las descargas o la interface web para monitorear tus descargas desde otra compu. Además es open source.
Por ejemplo, cuando termino las descargas corro un script que me ordena las series en sus respectivos directorios.
#!/bin/bash
cd "$HOME/Downloads"
# for filename in *; do
find . -type f | while IFS= read filename; do # Look for files in all ~/Download sub-dirs
case "${filename,,*}" in # this syntax emits the value in lowercase: ${var,,*} (bash version 4)
*.part) : ;; # Excludes *.part files from being moved
move.sh) : ;;
# *test*) mv "$filename" "$HOME/TVshows/Glee/" ;; # Using move there is no need to {&& rm "$filename"}
# *test*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Desktop/" && rm "$filename" ;;
*american*dad*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/American\ Dad/" && rm "$filename" ;;
*bored*to*death*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Bored\ To\ Death/Season\ 3/" && rm "$filename" ;;
*conan*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Conan/" && rm "$filename" ;;
*family*guy*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Family\ Guy/" && rm "$filename" ;;
*futurama*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Futurama/" && rm "$filename" ;;
*game*of*thrones*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Game\ Of\ Thrones/" && rm "$filename" ;;
*gossip*girl*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Gossip\ Girl/" && rm "$filename" ;;
*how*i*met*your*mother*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/How\ I\ met\ your\ mother/Season 7/" && rm "$filename" ;;
*modern*family*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Modern\ Family/Season\ 3/" && rm "$filename" ;;
*mythbusters*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Mythbusters/" && rm "$filename" ;;
*santurday*night*live*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/SNL/Season\ 37/" && rm "$filename" ;;
*the*big*bang*theory*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Big\ Bang\ Theory/Season\ 5/" && rm "$filename" ;;
*two*and*a*half*men*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Two\ and\ a\ Half\ Man/Season\ 9/" && rm "$filename" ;;
*united*states*of*tara*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/United\ States\ of\ Tara/Season\ 3/" && rm "$filename" ;;
*warehouse*13*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Warehouse\ 13/" && rm "$filename" ;;
*wilfred*) scp "$filename" "[email protected]:/users/iMac/Movies/Series/Wilfred/Season\ 1/" && rm "$filename" ;;
*) echo "Don't know where to put $filename" ;;
esac
done
Sobre la velocidad, es muy relativo. Podría ser un tema de configuración... Tendrías que probar con el mismo torrente y ver si existe una verdadera diferencia.
Edit: Creo uTorrent también puede hacer estás cosas, incluso es mucho más completo con el tema de los feed RSS.
iMac 27"
tremendo laburo ese script (Y), al menos no tenes que comprar la app 
